eCryptfs is a POSIX-compliant enterprise-class stacked cryptographic filesystem for Linux. You can use it to encrypt partitions and also directories that don't use a partition of their own, no matter the underlying filesystem, partition type, etc. This tutorial shows how to use eCryptfs to encrypt a directory on Debian Jessie.

L'implémentation de eCryptfs diffère de celle de dm-crypt, qui fournit une couche de chiffrement du périphérique de bloc, tandis que eCryptfs est un vrai système de fichier, ou plutôt un système de fichier de chiffrement basé sur les fichiers pour être exact. Pour comparer les deux, vous pouvez vous référer au site d'ecryptfs. En résumé, eCryptfs ne nécessite pas d'effort spécial pour son utilisation, telle une partition séparée : vous pouvez monter eCryptfs sur n'importe quel dossier afin de protéger celui-ci. Cela inclut par exemple votre dossier $HOME entier, ou bien des systèmes de fichiers de réseau (par exemple les partages NFS). Toutes les métadonnées cryptographiques sont stockées dans les en-têtes des fichiers, donc les données chiffrées sont déplaçables, archivables et récupérables facilement. Il y a d'autres avantages, mais il y a aussi des inconvénients, par exemple eCryptfs n'est pas conçu pour chiffrer complètement des partitions, ce qui signifie que vous ne pouvez pas lui demander de protéger votre espace swap (vous pouvez demander cela à dm-crypt.)
Voir aussi :
http://nwrickert2.wordpress.com/2012/09/07/using-ecryptfs-with-opensuse-12-2/
https://wiki.archlinux.org/index.php/ECryptfs

TruPax est un formidable petit logiciel gratuit développé en Java, qui permet de détourner légèrement la philosophie d'utilisation de TrueCrypt. En effet, quand on utilise TrueCrypt de manière classique, on crée un conteneur, qu'on monte et dans lequel on dépose ses fichiers. TruPax propose tout simplement de chiffrer avec TrueCrypt, un fichier ou un répertoire, pour en faire un conteneur à part entière, correctement ajusté à la taille des fichiers, utilisant le système de fichier UDF.